导读:2022年度科学突破奖(BreakthroughPrize)公布获奖名单,六名科学家斩获“生命科学科学突破奖”,包括开发二代DNA测序技术(Solexa测序)的ShankarBalasubramanian、David Klenerman和Pascal Mayer三位科学家,如果没有由三名科学家发明的下一代基因测序技术,人类几乎不可能立即识别和表征新冠病毒、快速开发疫苗以及实时监测新的变异病毒。
高通量测序技术(NGS)又被称为第二代基因测序技术,具有高输出量以及高解析度等优势,能够迅速读取序列,在提供丰富的遗传学信息的同时,还能够起到缩短测序时间的作用。
来自剑桥大学Shankar Balasubramanian、David Klenerman和Pascal Mayer三名科学家在1998年开发出了俗称Solexa Sequencing的DNA测序方法,作为二代DNA测序技术与基于Sanger法的DNA测序手法想比,具有压倒性的优势,比如测序速度快,可以自动测序,并且价格低廉,准确简便,并且多个DNA链可以同时并行的进行解析。
Shankar Balasubramanian(左)、David Klenerman(中)、Pascal Mayer(右)
这项新的DNA测序技术(Solexa测序)被剑桥大学的衍生公司(Solexa公司)进行了商业化,用于基因组学应用,包括人类基因组测序。Illumina于2006年收购Solexa公司,获得新一代高通量测序技术,从而成为目前市场上的主流测序技术公司,所占市场份额达80%。因为收购Solexa,也成为Illumina的转折点,从此踏上高速发展的道路。
随后2008年,新一代测序技术在人类个体基因组的开创性应用被公布。研究分别报道了一名非裔个体和一名亚裔个体的基因组。在这两项研究中,研究人员使用了Solexa测序的下一代测序技术,这一技术是目前Illumina公司短读测序仪的基础。第一版人类基因组图谱耗资30亿美元,耗时十几年。而使用下一代测序技术,在2008年可以在几周内完成一个人类基因组的测序工作,同时该项技术还将一个人类基因组的测序成本降低到50万美元。
如今,NGS技术下的人类基因组测序时间可以被压缩到仅有一天,成本600美元。这一技术彻底改变了生物学,也让我们能够快速进行基因测序,加快了生物学和医学的发展。
而大流行病期间,二代基因测序仪器用于新冠病毒检测中,可快速、准确检测临床样本并输出庞大的基因组数据,指导新冠病毒防治比如预防措施制定、核酸试剂盒及疫苗研发、药物研究等。同时,在监测病毒变异、病毒传染路径等方面。在这些领域,高通量基因测序仪具有它独特的优势,可以一次测出更多数据,而这些数据对于治疗方式的研发、迭代具有指导作用。